La FNAU a choisi d'éclairer prioritairement les enjeux des territoires français sous l'angle des "interrelations" et des "coresponsabilités" territoriales. Plusieurs idées directrices auxquelles sont attachées les agences d'urbanisme guident ce travail: l'approche pour les liens et la gouvernance pour la co-construction territoriale, l'analyse par les "écosystèmes économiques et d'innovation", la connaissance par les flux pour appréhender la "société mobile et connectée", les "biens communs" pour aborder les politiques territoriales, le développement humain et la qualité de vie pour aborder les disparités et les enjeux de cohésion territoriale.